Les UMR de l'Ecole

2 équipes: Unité antibiorésistance et virulence bactérienne (AVB) / Epidémiologie et appui à la surveillance (EAS) 
Site internet : https://www.anses.fr/fr/content/laboratoire-de-lyon#onglet0-tab
Liste encadrants ANSES rattachés à l'ED E2M2

3 équipes : Symbiose : génomique fonctionnelle des interactions trophiques(SymT), Symbiose : signalisations immunitaires (SymSim),  InEn : ingénierie autour de l'insecte (InEn)

6 équipes: Transfert de gène horizontal chez les bactéries pathogènes (HORIGENE); Pathogenèse des Légionelles (LEGIOPATH); Virologie et pathologie humaines (VIRPATH); Pathogénie des Staphylocoques (SPAPATH), Santé publique, épidémiologie et écologie évolutive des maladies infectieuses (PHE3ID), Persistance et dynamique à l'échelle de la cellule ainsi que des pathogènes respiratoires (PERSIST)
Site internet : ciri.ens-lyon.fr/
Liste encadrants CIRI rattachés à l'ED E2M2

1 équipe : Biomodélisation

1 équipe : Biophysique (1 chercheur)
Site internet : https://ilm.univ-lyon1.fr
Liste encadrants ILM rattachés à l'ED E2M2

3 équipes: Al Ways, Bunya Virusn Retrovirus PR2T
Site internet : https://www6.lyon-grenoble.inrae.fr/ivpc
Liste encadrants IVPC rattachés à l'ED E2M2

13 équipes: Baobab, Biodémographie, Bioinformatique PGE, Biostat Santé, Comportement EAC, Ecoépidémiologie,  Ecologie EQEC,  Intéraction GEIHP, Le Cocon, Modélisation et écotoxicologie prédictives, Populations EEP, Sexe et évolution, Thépareutique EMET,  
Site internet : http://lbbe.univ-lyon1.fr
Liste encadrants LBBE rattachés à l'ED E2M2

5 équipes: Biodiversité et adaptation dans les hydrosystèmes (BAH) / Ecophysiologie, comportement, conservation (E2C) / Ecologie, évolution, écosystèmes souterrains (E3S) / Ecologie végétale et zones humides (EVZH) / Paléontologie, paléoécologie, paléobiogéographie, évolution (P3E)
Site internet : https://umr5023.univ-lyon1.fr
Liste encadrants LEHNA rattachés à l'ED E2M2

7 équipes: Bactéries pathogènes opportunistes et environnement / Diversité et adaptation des bactéries phytopathogènes / Diversité fonctionelle et cycle de l'azote / Résistance environnementale et efflux bactérien / Rhizosphère / Symbiose actinorizienne / Dynamique microbienne et transmission virale
Site internet : http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr
Liste encadrants LEM rattachés à l'ED E2M2

2 équipes: Biosignatures - Vie primitive; Paléoenvironnement et Paléobiodiversité; 

5 équipes: Champignons, Chromatine CRPB, Levures, Milieu extrême, MTSB
Site internet : https://map.insa-lyon.fr
Liste encadrants MAP rattachés à l'ED E2M2

2 équipes : Signalétique et asymétrie de la cellule bactérienne; Transfert d’ADN entre cellules bactériennes
Site internet : https://mmsb.cnrs.fr
Liste encadrants MMSB rattachés à l'ED E2M2

1 équipe: Mycoplasmines animales
Site internet : http://www.vetagro-sup.fr/recherche-expertise/les-unites-de-recherche/mycoplasmoses-animales/
Liste encadrants MYCO rattachés à l'ED E2M2

1 équipe

3 équipes: Ecohydrologie ECOFLOWS;  Ecotoxicologie ECOTOX; EcotoxMicrobienne EMA