Les UMR de l'Ecole

3 équipes: Unité antibiorésistance et virulence bactérienne (AVB) / Epidémiologie et appui à la surveillance (EAS) / Mycoplasmoses animales (MYCO) 
Site internet : https://www.anses.fr/fr/content/laboratoire-de-lyon#onglet0-tab

3 équipes : Symbiose : génomique fonctionnelle des interactions trophiques(SymT) / Symbiose : signalisations immunitaires (SymSim) /  Ingénierie autour de l'insecte (InEn)

7 équipes: Transfert de gène horizontal chez les bactéries pathogènes (HORIGENE) /  Pathogenèse des Légionelles (LEGIOPATH) / Virologie et pathologie humaines (VIRPATH) / Pathogénie des Staphylocoques (SPAPATH) / Santé publique, épidémiologie et écologie évolutive des maladies infectieuses (PHE3ID) / Persistance et dynamique à l'échelle de la cellule ainsi que des pathogènes respiratoires (PERSIST) / Génomique fonctionnelle des interactions bactéries-bactériophages (GENOMIC)
Site internet : ciri.ens-lyon.fr/

Site internet; Epidémiologie des maladies animales et zoonotiques - VetAgro Sup (vetagro-sup.fr)

1 équipe : Biomodélisation

1 équipe : Biophysique
Site internet : https://ilm.univ-lyon1.fr

3 équipes: Infections arbovirales d'hôte à hôte et de cellule à cellule (Al Ways) /  Biologie des Bunyavirus (Bunya Virus) / Physiopathologie, rétrovirus, tumeurs rares (PR2T)
Site internet : https://www6.lyon-grenoble.inrae.fr/ivpc

12 équipes: Baobab / Biodémographie évolutive (EE) / Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive (BPGE) / Biostatistique santé (BS) / Ecologie et évolution des populations (EEP) / Ecologie quantitative et évolutive de communautés (EQEC) / Evaluation et modélisation des effets thérapeutiques (EMET) / Evolution, adaptation et comportement (EAC) / Génétique et évolution des interactions (GEI) / Génomique évolutive et fonctionnelle (GEF) / Sciences de l'évolution au risque de l'anthropocène (SERA) / Groupe de modélisation prédictive et d'écotoxicologie (IMPACT)  
Site internet : http://lbbe.univ-lyon1.fr

5 équipes: Biodiversité et adaptation dans les hydrosystèmes (BAH) / Ecophysiologie, comportement, conservation (E2C) / Ecologie, évolution, écosystèmes souterrains (E3S) / Ecologie végétale et zones humides (EVZH) / Paléontologie, paléoécologie, paléobiogéographie, évolution (P3E)
Site internet : https://umr5023.univ-lyon1.fr

7 équipes: Bactéries pathogènes opportunistes et environnement (BPOE) / Diversité et adaptation des bactéries phytopathogènes (DABP) / Diversité fonctionelle et cycle de l'azote (DIVE-N) / Résistance environnementale et efflux bactérien (BEER)/ Rhizosphère (RHIZO) / Symbiose actinorizienne (SYM) / Dynamique microbienne et transmission virale (DMTV)
Site internet : http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr

2 équipes: Biosignatures - Vie primitive (BVP) / Paléoenvironnement et Paléobiodiversité (4PAL)

6 équipes: Génomique fonctionnelle des champignons pathogènes des plantes (FGPF) / Chromatine et régulation de la pathogénie bactérienne (CRP) / Signalisation et mécanismes adaptatifs chez les levures  (SMAL) / Microbiologie des environnements extrêmes (M2E) / Trafic et signalisation membranaires chez les bactéries (MTSB) / Interactions dynamiques entre plante-microbes et environnement (SPMIR)
Site internet : https://map.insa-lyon.fr

3 équipes : Signalétique et asymétrie de la cellule bactérienne (SACB) / Transfert d’ADN entre cellules bactériennes (TACC) / Ecologie moléculaire et évolution des phages (MEEP)
Site internet : https://mmsb.cnrs.fr

1 équipe

3 équipes: Ecohydrologie (ECOFLOWS) / Ecotoxicologie (ECOTOX) / Ecoto Microbienne aquatique (EMA)