=> dernière mise à jour le 12/05/2021

Les sujets du concours E2M2 seront publiés, au fur et à mesure de leur réception, après vérification des critères de dépôt par l'école doctorale E2M2
Format = "titre", "unité de recherche", "couleur scientifique", "encadrants"

1- Mécanismes impliqués dans la persistance chez Legionella pneumophila en lien avec la tolérance aux antibiotiques / Legionella pneumophila persistance mechanisms in relation to antibiotics tolerance, CIRI, MICRO, GILBERT Christophe
2- Rôle des éléments transposables dans l’histoire évolutive des gènes dupliqués chez les drosophiles, LBBE, BIOM, LERAT Emmanuelle & RIZZON Carène
3- Impact of bacterial coinfection on host response, CIRI, MICRO, MOREAU Karen & PETIOT Emma
4- RNA processing and glucose signaling in yeasts: roles and mechanisms of a PIN domain ribonuclease, MAP, MICRO, LEMAIRE Marc & SOULARD Alexandre
5- The eco-evolutionary roots of male reproductive ageing in the wild, LBBE, BIOEV, LEMAITRE Jean-François & GAILLARD Jean-Michel
6- Influence de la longirostrie sur la variabilité inter- et intraspécifique des structures endocrâniennes chez les crocodiliens, LGLTPE, PALEO, MARTIN Jérémy & HAUTIER Lionel
7- Protéomique comparée bactérie phytopathogène / plante au cours de l’infection, rôle du master régulateur Zur, MAP, MICRO, RODRIGUE Agnès & CONDEMINE Guy
8- The Toscana virus protein NSs and induced cell death in infected cells, IVPC, MICRO, LOZACH Pierres-Yves & RATINIER Maxime
9- Une fenêtre sur la terrestrialisation des arthropodes, étude des Myriapodes du gisement à préservation exceptionnelle de Montceau-les-Mines (Carbonifère, 305Ma), LGLTPE, PALEO, PERRIER Vincent & ESCARGUEL Gilles
10- The hexokinase phosphorylation landscape: new regulation of an “old” enzyme, MAP, MICRO, SOULARD Alexandre & LEMAIRE Marc
11- Influence des infections virales sur le taux de transposition chez la drosophile, LBBE, BIOM, FABLET Marie
12- In-depth characterization of pathogen specific T-cells in tuberculosis patients, CIRI, MICRO, ADER Florence & DUMITRESCU Oana
13- Rôle des macro-vésicules de sécrétion dans la stratégie infectieuse du champignon phytopathogène Botrytis cinerea, MAP, MICRO, BRUEL Christophe & CHOQUER Mathias
14- Understanding the role of blood pressure changes in the treatment of hypertension, LBBE, BIOM, GUEYFFIER François & ROY Pascal
15- Stress nutritionnel et régulation de la virulence bactérienne : rôle de la Protéine Associée au Nucléoïde, LRP chez la bactérie Dickeya dadantii, MAP, MICRO, NASSER Henri William
16- Identification des mécanismes de communication interrègne : comment Candida albicans module la virulence de Staphylococcus aureus ? / Identification of inter-kingdom communication mechanisms: how Candida albicans modulates Staphylococcus aureus virulence ?, CIRI, MICRO, LINA Gérard
17- Étude et modélisation de l'impact des vaccins et de la sélection génétique des variants sur le modèle coqueluche, LBBE, BIOEV, PONTIER Dominique & FOUCHET David
18- Assessing evolutionary and demographic processes accross bird species to improve their conservation, LBBE, BIOEV, DEVILLARD Sébastien & MILLON Alexandre
19- Conséquences écologiques et effets ecotoxicologiques des microplastiques sur le fonctionnement des sols, LEM, ECO, RICHAUME-JOLION Agnès & LAMY Isabelle
20- Characterization of the underlying mechanisms of severity of acute respiratory infections in the context of co-infections between viruses and bacteria using a reconstructed human epithelium model, CIRI, MICRO, TERRIER Olivier
21- Caractérisation des mécanismes moléculaires régulant la physiologie des cellules symbiotiques chez un insecte d’intérêt agronomique, BF2i, MICRO / BIOM, CALEVRO Federica & PARISOT Nicolas
22- High Performance Computing and Machine Learning in support of
Toxicokinetic-Toxicodynamic Modelling for the understanding of Mixture
Effects (MaXiM)
, LBBE, BIOM, CHARLES Sandrine & BAUDROT Virgile
23- Les levures environnementales : diversité et impact sur le comportement du moustique tigre, LEM, MICRO, LUIS Patricia, VALIENTE MORO Claire & HAY Anne-Emmanuelle
24- Parasitic interactions and their modulation by the microbiota of the Asian tiger mosquito Aedes albopictus, LEM, MICRO, MINARD Guillaume, VALIENTE MORO Claire & HAY Anne-Emmanuelle
25- Effet de la pollution lumineuse nocturne sur les interactions macrophytes - herbivores dans les zones humides, LEHNA, BIOEV, MONDY Nathalie & PUIJALON Sara
26- Immune response against SARS-CoV-2: impact of viral variants, vaccination, and protection against reinfection, TROUILLET-ASSANT Sophie & POZZETTO Bruno
27- Deciphering the polar lipid synthesis pathway in the polyextremophilic Archaea and the relative contribution of each polar lipid family in the adaptation to extreme environmental conditions, MAP, MICRO, OGER Philippe & FONTANAY Stéphane
28- Création puis validation à l'aide d'outils de modélisation issus de l’intelligence artificiel de deux outils d’estimation du risque des patients insuffisants rénaux. Le premier permettra d’estimer le risque de de morbi-mortalité totale et/ou cardiovasculaire et le second permettra d’estimer le risque d’évolution vers l'insuffisance rénale terminale, LBBE, BIOM, FAUVEL Jean-Pierre & DUCHER Michel
29- Spatio-temporal modelling of 4-way interactions between a virus, its target plant, its insect vector, and predators of the insect, BOUSSAU Bastien & GIRARDIN Léo
30- Une exploration de la contribution des virus domestiqués au transfert horizontal d’ADN, LBBE, BIOM, CHARLAT Sylvain & VARALDI Julien
31- Investigation of the internalization and intracellular survival of Staphylococcus capitis in non-professional phagocytic cells, CIRI, MICRO, LAURENT Frédéric & JOSSE Jérôme
32- Résilience des plantes aquatiques à l’exondation : réponses morphologiques et écophysiologiques des traits foliaires, LEHNA, ECO, VERNAY Antoine & PUIJALON Sara
33-  Etude de la dissémination de bactéries motiles sur des surfaces minérales, prélude au processus de fossilisation en paléontologie et exobiologie, LGLTPE, PALEO, LEMELLE Laurence & PLACE Christophe
34- Evolutionary shift in morphological and life-history traits during colonization of subterranean habitats, LEHNA, BIOEV, DOUADY Christophe & MALARD Florian
35- Modeling the growth of mineralized tissues in non-mammalian odontodes: implications for their morphogenesis and for the ontogeny and plasticity of polyodontodes, IGFL, PALEO, GOUDEMAND Nicolas
36- Changement climatique, phénologie florale et dynamique interannuelle de la reproduction des plantes pérennes, LBBE, BIOEV, VENNER Samuel & LOBRY Jean
37- Predicting hybridization patterns with comparative phenotypic trait measurements and habitat modelling, LEHNA, BIOEV, ESCARGUEL Gilles & KAUFMANN Bernard
38- Analyse du microbiote des sols résistants aux maladies fongiques des plantes, LEM, MICRO, MULLER Daniel
39- Effets du stress physiologique sur la cognition et ses liens avec la valeur sélective en milieu naturel: approches empiriques, LBBE, BIOEV, DOLIGEZ Blandine & BIZE Pierre
40- Microbiote racinaire et nutrition phosphorée des plantes non-mycorhiziennes, LEM, MICRO, ALMARIO Juliana & MOENNE-LOCCOZ Yvan
41- Approches démo-génétiques de la compréhension de la variabilité intra-spécifique du fonctionnement des populations : le cas du cerf élaphe (Cervus elaphus), LBBE, BIOEV, SAY Ludovic & DEVILLARD Sébastien
42- Characterizing the coevolution between the gut microbiota and human hosts, with a focus on the influence of industrialization, LBBE, BIOEV, SEGUREL Laure & DAUBIN Vincent
43- Etude de la distribution et de la diversité des populations d’Alnus, des symbiotes Frankia associés et du cycle de l’azote en zone humide de la Dombes dans un contexte de changement climatique, LEM, MICRO, HERRERA-BELAROUSSI Aude & KIM TIAM Sandra
44- Dynamique spatio-temporelle de la végétation aquatique : effet des facteurs hydrodynamiques et hydrologiques, LEHNA, ECO, PUIJALON Sara
45- Importance of behavioural plasticity in conservation: comparison of the behavioural performances of two benthic freshwater fish species, LEHNA, BIOEV, DECHAUME-MONCHARMONT François-Xavier & MEDOC Vincent
46- Réponses évolutives des amphibiens à la pollution lumineuse, LEHNA, BIOEV, SECONDI Jean & LENGAGNE Thierry
47- The shaping of life by oxygen: from single cell to multicellular dynamics, ILM, MICRO, ANJARD Christophe & RIEU Jean-Paul
48- Influence of antibiotics on the dissemination of resistance by bacterial DNA conjugation, MMSB, MICRO, LESTERLIN Christian & BIGOT Sarah
49- Cartographie des protéines architecturales sur le chromosome de la bactérie phytopathogène Dickeya dadantii, MAP, MICRO, MEYER Sam & REVERCHON Sylvie
50- Génomique des populations intégrative: de la phylogénie à la génétique des populations, LBBE, BIOM, LARTILLOT Nicolas
51- Molecular determinants of oncogenic switch in β-Retrovirus enzooties, IVPC, MICRO, LEROUX Caroline & TURPIN Jocelyn